一番大きな違いはロタリックスが1価のワクチンであるのに対し、ロタテックは5価のワクチンであることです。が、数が多い方が優れているかというと、そうでもないようです。
ヒトからは42種類のロタウイルスが見つかっており、胃腸炎を起こすのはG1P[8]、G2P[4]、G3P[8]、G4P[8]、G9P[8]の5通りの組み合わせがほとんどです。
ロタリックスはG1P[8]1種類のヒトロタウイルス株を弱毒して作ったワクチンですが、G2P[4]、G3P[8]、G4P[8]、G9P[8]の他の種類のロタウイルスに対する予防効果も認められています。（ほとんどのヒトロタウイルス胃腸炎に有効、G2Pにはやや弱いとの報告がある）。
一方ロタテックはウシロタウイルスV7に、ヒトロタウイルスのG1、G2、G3、G4を持つＶ７遺伝子を、遺伝子組み換えによって組み込んだ、リアソータント（遺伝子組み換え）ウイルス４種と、さらにウシロタウイルスVP4の代わりに、P[8]遺伝子を持つヒトＶ４遺伝子を遺伝子組み換えによって組み込んだ、リアソータントウイルス1種の、計５種のウイルスを混合したものです。このワクチンは、G1、G2、G3、G4、P[8]が含まれているため、ヒトに病原性を持つG1P[8]、G2P[4]、G3P[8]、G4P[8]、G9P[8]の全てのロタウイルスをカバーした予防効果が認められています。
ロタリックスはヒトロタウイルス由来なので、腸の中でよく増え、腸管からの排泄も多く、周囲への感染があるかもといわれています。ロタテックはウシロタウイルス由来ですので人の腸内での繁殖が悪く、その分周囲への感染は少ないかもわかりませんが、抗体獲得確率も低くなるので、ワクチン内のウイルス量が多く接種量も多くなっています。接種回数も3回です。

二つのワクチンの違いを表にしてみました。

1価よりも5価の方が明らかに優れている、という訳でもなさそうです。効果に関してはあまり差はないようです。むしろ1価ワクチンの方がヒトワクチン由来ですので、予防効果の％がやや高いという報告もあります。
発売開始されてまだ間も無いのですが、ロタテックの接種をしました。投与する側からいえば、容器の形状によるのか、量は多くても、ロタリックスよりは飲ませやすかったです。蓋をあける際に中栓がワクチンの中に落ちてしまう、というロタリックスの欠点は当院でも経験したのですが、ロタテックにはそれはありません。接種回数が多いため、3回通わないといけないのですが、最後は32週まで(生後8か月になるまで）に飲むことができればいいので、BCGの接種を挟んだり、一度にたくさんのワクチンを受けることに抵抗がある方でも、スケジュールを組む余裕があるかと思います。